活清複合菌中的有益菌群，各自發揮重要作用，特別是光合菌的固氮作用，從根本上支持其他微生物的繁殖，以達到菌群之間的協同作用，使各菌群活躍於土地中，可大幅改善土壤環境，並抑制有害微生物及線蟲繁殖，有利農作物生長發育順利，植物病蟲害就難以發生，以達土壤健康及永續利用。
